全日制

1. 済々黌高等学校
2. 熊本高等学校
3. 第一高等学校
4. 第二高等学校
5. 熊本西高等学校
6. 熊本北高等学校
7. 東稜高等学校
8. 湧心館高等学校
9. 玉名高等学校
10. 岱志高等学校
11. 鹿本高等学校
12. 菊池高等学校
13. 大津高等学校
14. 阿蘇中央高等学校
15. 小国高等学校
16. 高森高等学校
17. 御船高等学校
18. 甲佐高等学校
19. 宇土高等学校
20. 松橋高等学校
21. 八代高等学校
22. 八代清流高等学校
23. 八代東高等学校
24. 水俣高等学校
25. 人吉高等学校
26. 人吉高等学校五木分校
27. 天草高等学校
28. 天草高等学校倉岳校
29. 牛深高等学校
30. 上天草高等学校
31. 熊本商業高等学校
32. 球磨中央高等学校
33. 鹿本商工高等学校
34. 熊本工業高等学校
35. 玉名工業高等学校
36. 小川工業高等学校
37. 八代工業高等学校
38. 球磨工業高等学校
39. 天草工業高等学校
40. 熊本農業高等学校
41. 北稜高等学校
42. 鹿本農業高等学校
43. 菊池農業高等学校
44. 翔陽高等学校
45. 矢部高等学校
46. 八代農業高等学校
47. 八代農業高等学校泉分校
48. 芦北高等学校
49. 南稜高等学校
50. 天草拓心高等学校
51. 盲学校
52. 熊本聾学校
53. ひのくに高等支援学校
54. 鏡わかあゆ高等支援学校
55. 熊本市立必由館高等学校
56. 熊本市立千原台高等学校
57. 九州学院高等学校
58. 鎮西高等学校
59. 真和高等学校
60. 開新高等学校
61. 熊本学園大学付属高等学校
62. 東海大学付属熊本星翔高等学校
63. 尚絅高等学校
64. 慶誠高等学校
65. 熊本国府高等学校
66. 熊本マリスト学園高等学校
67. ルーテル学院高等学校
68. 熊本信愛女学院高等学校
69. 熊本中央高等学校
70. 文徳高等学校
71. 八代白百合学園高等学校
72. 秀岳館高等学校
73. 玉名女子高等学校
74. 有明高等学校
75. 菊池女子高等学校
76. 専修大学玉名高等学校
77. 城北高等学校

定時制

1. 湧心館高等学校
2. 岱志高等学校
3. 玉名高等学校
4. 水俣高等学校
5. 人吉高等学校
6. 天草高等学校
7. 熊本工業高等学校
8. 八代工業高等学校

通信制

1. 湧心館高等学校
2. くまもと清陵高等学校
3. 勇志国際高等学校
4. クラーク記念国際高等学校 熊本キャンパス
5. 一ッ葉高等学校 熊本
6. 志成館高等学院
7. くまもと中央高等学院
8. やまと高等学校